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        College of Biological Science and Engineering

        洪曉昆

        發布日期:2024-09-09 發布者:

        姓名:洪曉昆

        性別:

        職稱:副研究員(校聘)/碩士生導師

        學歷:博士研究生

        電子郵件:hongxk@fzu.edu.cn

        研究方向:生物信息學

        研究生招生專業生物工程(學碩)、生物技術與工程(專碩)

        教育工作經歷:

        20238-至今:beat365在線體育官網 | beat365在線體育官網

        20189-20236月:上海交通大學 |系統生物醫學研究院 | 生物學 | 博士

        20158-20186月:中山大學 | 生命科學學院 | 動物學 | 碩士

        20119-20156月:beat365在線體育官網 | beat365在線體育官網 | 生物工程 | 本科

        教學簡介:

        科研簡介:

        主要研究領域為蛋白質翻譯后修飾的系統生物學研究,包括:1. 蛋白質翻譯后修飾數據庫;2. 蛋白質翻譯后修飾調控蛋白功能的計算解析;3.蛋白質翻譯后修飾的人工智能預測方法。目前已在Bioinformatics、J Chem Inf Model、 Int J Biol Macromol和J Chem Theory Comput等生物學知名期刊發表SCI論文14篇(中科院1區3篇、中科院2區5篇),其中以第1作者發表論文6篇。授權2項發明專利和2項計算機軟件著作權。兼任福建省生物信息學會會員、上海市生物信息學會會員以及Briefings in Bioinformatics審稿人。

        科研項目:

        主持beat365在線體育官網科研啟動基金1項、測試基金1項;

        參與國自然面上項目2項。

        代表性論文:

        1. Hong X, Li N, Lv J, Zhang Y, Li J*, Zhang J*, Chen HF*. PTMint database of experimentally verified PTM regulation on protein-protein interaction. Bioinformatics. 2023 Jan 1;39(1):btac823

        2. Hong X, Song K, Rahman MU, Wei T, Zhang Y, Da LT*, Chen HF*. Phosphorylation Regulation Mechanism of β2 Integrin for the Binding of Filamin Revealed by Markov State Model. J Chem Inf Model. 2023 Jan 23;63(2):605-618

        3. Hong X, Lv J, Li Z, Xiong Y, Zhang J*, Chen HF*. Sequence-based machine learning method for predicting the effects of phosphorylation on protein-protein interactions. Int J Biol Macromol. 2023 Jul 15;243:125233

        4. Hong X#, Guo T#, Xu X*, Lin J*. Multiplex metabolic pathway engineering of Monascus pilosus enhances lovastatin production. Appl Microbiol Biotechnol. 2023 Nov;107(21):6541-6552

        5. Hong X#, Liu X#, Su B*, Lin J*. Improved Antimicrobial Activity of Bovine Lactoferrin Peptide (LFcinB) Based on Rational Design. Protein J. 2023 Dec;42(6):633-644

        6. Hong XK#, Zhang X#, Fusco OA, Lan YG, Lun ZR*, Lai DH*. PCR-based identification of Trypanosoma lewisi and Trypanosoma musculi using maxicircle kinetoplast DNA. Acta Trop. 2017 Jul;171:207-212.


        授權專利情況

        1. 一種檢測路氏錐蟲的引物對和試劑盒。

        2. 一種檢測小鼠錐蟲的引物對和試劑盒。


        授權軟件著作權情況

        1. 翻譯后修飾調控蛋白互作的數據查詢系統【簡稱:PTMint】。

        2. 磷酸化修飾調控蛋白互作的人工智能預測系統【簡稱:PhosPPI】。

        獲獎情況:

        1. 上海交通大學優秀畢業生

        2. 碩士研究生國家獎學金

        3. beat365在線體育官網本科生優秀畢業設計(論文)



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